微生物学实验室建成于2016年9月，包括教学实验室（108平方米）和准备室（36平方米），可同时容纳40名学生上课，主要承担医学院本科临床专业和护理专业的医学微生物学实验教学任务，同时还为本科生自主科研提供必要的平台。本实验室配有生物显微镜、全自动高压灭菌器、净化工作台、细菌培养箱、电子天平、冷冻离心机、紫外可见分光光度计、超声波细胞粉碎机、蛋白和核酸电泳系统、核酸扩增仪、超微量分光光度计等教学用实验仪器。

实验室开展了细菌、病毒、真菌相关的形态、鉴定、生理、检测等相关实验，除了微生物学实验操作，同时涵盖了免疫学、分子生物学等课程的交叉实验技能。实验室旨在理论教学的基础上，通过实验理论和技能教学的开展，进一步夯实学生对知识点的理解，培养学生的动手能力、思考和解决问题的能力，并训练学生的基本科研素养和操作技能。